中科院新疆自然博物館是目前新疆生態學、地理學、生物學最具規模、內容最豐富的自然科學博物館。

博物館共兩層，展廳設計面積2600㎡。分為獨特氣候、巍峨山地、瀲滟水系、浩瀚荒漠、綠色生命等十個主題展示部分，共計350余塊版面。

現館藏展示標本最早可追溯到1958年中科院新疆綜考隊動植物標本，

種類包括植物、動物（含哺乳、爬行、兩棲、鳥類、昆蟲等）、微生物、土壤、礦產等各類標本3500余號，在新疆名列前茅。